Описание
Набор реагентов СПОЛИГО-БИОЧИП предназначен для типирования микобактерий туберкулёзного комплекса с использованием специализированного биочипаНазначение набора:
Набор позволяет дифференцировать микобактерии туберкулезного комплекса, в т.ч. различать возбудителя туберкулеза человеческого и бычьего типов, а также определять принадлежность к основным семействам Mycobacterium tuberculosis, таким как Beijing, LAM9, T1, T5, Haarlem и др., что важно не только с эпидемиологической, но и с клинической точки зрения. Так, изоляты семейства Beijing преобладают у больных с тяжелыми формами туберкулеза, демонстрируют высокую вирулентность и трансмиссивность, ассоциацию с множественной лекарственной устойчивостью.
Принцип работы:
Принцип действия набора основан на анализе региона прямых повторов (DR = direct repeat, англ) генома микобактерий туберкулезного комплекса. Исследование данного генетического локуса позволяет однозначно определить профиль штамма микобактерий туберкулезного комплекса по наличию/отсутствию 43 последовательностей спейсеров, фланкированных прямыми повторами. Методика проведения анализа с использованием набора СПОЛИГО-БИОЧИП включает одну стадию ПЦР и последующей гибридизации полученных ПЦР-продуктов на биочипе. Биочип включает 43 элемента, каждый из которых содержит уникальный зонд, специфичный к одному из 43 спейсеров региона прямых повторов. Интерпретация результатов гибридизации на биочипе осуществляется программно в автоматическом режиме с выдачей информации о профиле (сполиготипе) штамма микобактерий туберкулезного комплекса в соответствии с международной базой данных SPOLDB4 (www.pasteur.fr/ip/easysite/pasteur/fr).
-
Основные характеристики:
- Аналитическая чувствительность — 400 геном-эквивалентов микобактериальной ДНК;
- Специфичность: набор выявляет 43 нуклеотидных последовательности спейсеров региона прямых повторов со специфичностью не менее 99,5%.
- Время проведения анализа – не более 1 суток.
-
Состав тест-системы:
- Комплект N1 для выделения микобактериальной ДНК (поставляется по запросу);
- Комплект N2 для проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР);
- Комплект N3 для проведения гибридизации;
- Комплект N4, включающий биологические микрочипы.
Для получения точного профиля сполиготипирования для анализа рекомендуется использовать образцы ДНК, выделенные из клинических изолятов. При анализе клинического материала (мокрота, бронхоальвеолярный лаваж, экссудат, содержимое холодных абсцессов) в силу вероятного присутствия смешанных популяций штаммов возможно получение неинтерпретируемой гибридизационной картины.
Тест-система «Сполиго-биочип» (Инструкция)
Обзоры
Отзывов пока нет.